第三，经费投入不足，办学条件亟待改善。
残疾人教育具有特殊性，如专用设备的购置、个别化教育教学的推进等，决定了特殊教育需要比普教投入更多的经费。由于经费的不足，造成特殊教育的办学条件普遍较差，有的甚至很差。许多学校，校舍破旧，设备奇缺，专用教学和康复设备更是匮乏。一些近年新建的特殊教育学校在校舍建成以后，也没有能够及时地配备专用设备和学具、教具，严重影响学校的办学质量。对残疾学生的资助、保障体系还不够健全，不少残疾学生面临学习、生活等诸多方面的困难。
第四，特教师资短缺，特教专业队伍尚不稳定。
国家还没有普遍建立起经常化、制度化的特教教师培训制度。全国只有少数的师范大学开设特教专业，国外几乎所有的进行教师教育的学校都开设特殊教育的必修课，但在我国只有华东师范大学、北京师范大学等个别学校在教师教育中开设特殊教育的公共选修课，因此，教师教育中的“特教盲”还不断地出现，经过特教专业训练的学历合格的教师严重缺乏，特教专业毕业的或接受过特教专业各种期限不等培训的只有1/2。一些教师对残疾学生的心理、生理特点了解甚少，只能用普通教育的方法从事特殊教育工作。由于特殊教育学校条件差、待遇低，甚至不少地方连规定的15%的特教津贴都不能兑现，造成特教师资队伍不稳定，这种状况严重影响了特殊教育质量的提高。